Средняя школа с. Лидога, расположенная по улице Первомайская д.9а, открылась в сентябре 1978 года (акт приёмки в эксплуатацию Государственной приёмочной комиссией законченного строительством здания жилищно-гражданского назначения от сентября 1978г, утверждённый решением  исполнительного комитета Нанайского районного совета народных депутатов от 22.11.1978г № 262).

05 февраля 1993 года Лидогинская средняя школа переименована в Лидогинскую среднюю общеобразовательную школу (постановление главы района от 05.02.1993 г. № 89).

30 мая 1995г Лидогинская средняя общеобразовательная школа переименована в Лидогинскую муниципальную полную среднюю общеобразовательную школу Нанайского района Хабаровского края  (постановление главы района от 30.05.1995г

№ 188).

23.03.1999 года Лидогинская муниципальная полная средняя общеобразовательная школа Нанайского района Хабаровского края  переименована в Муниципальное образовательное учреждение среднюю общеобразовательную школу с. Лидога (постановление главы района от 23.03.199г  № 87).

С 24.02.2005г Муниципальное образовательное учреждение средняя общеобразовательная школа с. Лидога переименовано в Муниципальное общеобразовательное учреждение среднюю общеобразовательную школу Лидогинского сельского поселения Нанайского муниципального района Хабаровского края (постановление главы района  от 24.02.2005г № 33).

С 07.11.2011г Муниципальное общеобразовательное учреждение средняя общеобразовательная школа Лидогинского сельского поселения Нанайского муниципального района Хабаровского края переименовано в Муниципальное казённое общеобразовательное учреждение среднюю общеобразовательную школу Лидогинского сельского поселения Нанайского муниципального района Хабаровского края (постановление главы района  от 07.11.2011г № 1048).

МКОУ СОШ Лидогинского сельского поселения Нанайского муниципального района Хабаровского края зарегистрировано  в налоговом органе как юридическое лицо (свидетельство о постановке на учёт российской организации с присвоением ИНН/КПП 271406717/271401001, серия и номер  документа : 27 № 001680724).

С 07.10.2014 г Муниципальное казённое общеобразовательное учреждение средняя общеобразовательная школа Лидогинского сельского поселения Нанайского муниципального района Хабаровского края переименовано в Муниципальное бюджетное общеобразовательное учреждение «Средняя общеобразовательная школа с. Лидога» (постановление главы района от 07.10.2014 г № 1374).

С 10.03.2016 г при МБОУ СОШ с. Лидога открыт Филиал МБОУ СОШ с. Лидога ( постановление главы района от 26.10.2015 г № 946)